まず、疑問に思うことは、我々不動産業を営むものが通常業務に関して、営業個人の口座番号を教えるというケースは有りません。
ご相談者様は、「仲介手数料だけ何故か個人口座指定で振り込んでしまいました」とのことですが、それは誰かからその個人口座番号を言われて指示されたということかということでしょうか？
仲介手数料は無料という事なので、まずは取り扱った不動産会社に事情を説明して対応をお願いしてみると良いでしょう。
振込の控えは捨てないで証拠として手元に置いておいてください。
不動産会社が対応しなければ、都庁に相談窓口がありますのでそこで相談するとよいでしょう。
それでも事態が好転しなければ弁護士などに依頼する流れになりますが、文面からは押して、明らかに宅建業法違反なので、何らかの進展はあると思います。

回答日：2018/10/11

※株式会社いえらぶGROUPは、回答内容の正確性、完全性または有用性等について、一切の責任を負いかねます。