江戸川区で不動産管理業、及び賃貸業を営んでいるF・リンクホームの彦田と申します。
契約書を見ていないので、憶測とこれまでの経験からお答えをさせて頂きます。

引っ越しの際、鍵交換代は請求されると思われた方が宜しいかと思います。
物件によっては、どなたかが鍵を失くされた場合、オートロックの内部システムの一部（鍵の暗唱システム）を変える必要がある物がございます。そういった手間賃や人件費、鍵の取り寄せ代等を請求される場合があります。

管理会社様がどんな意図をもって「鍵の紛失などがない場合～」と記載をしたのか疑問が残ります。

ただし、国土交通省の「原状回復をめぐるトラブルとガイドライン」という物には「鍵交換代は貸主が負担をすべき」との記載があります。
是非早めに管理会社様にお話しをし、鍵の交換代についてはお話合いを持たれるのが宜しいかと思われます。

私の意見はセカンドオピニオン的に捉えて頂き、管理会社様、オーナー様と円満な解決を図って下さい。

回答日：2019/10/16

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